PH på bottennivå

Det låter mer rimligt.
Kommunalt vatten kan, när det får stå ett tag, dessutom sjunka något till ca pH 7
Den sänkning du har till 6-6.5 kan mycket väl bero på rötterna, men knappast något du behöver oroa dig för.

Edit:

Kan det vara så att behållaren du hade vattnet i när du fick det mätt tidigare kan ha varit förorenad?