Hemiancistrus sabaji är en allätande art, men den lutar starkt mot en vegetarisk diet. I ett akvarium bör den ges grönfoder, men detta bör kompletteras med frysfoder såsom mygglarver, artemianauplier och räkor. Det finns få rapporter om artens fortplantning, men det är känt att den är en grottruvare och det är hanen som vaktar avkomman. Antalet avkomma i en kull varierar mellan 80 och 150.
Denna art är huvudsakligen aktiv under skymningen och natten, men den är inte extremt skygg. Det är en fredlig art som trivs bäst när den inte hålls tillsammans med alltför stora fiskar, eftersom det gör den mer blyg. Akvariet bör innehålla många gömställen, gärna i form av rötter och stenar som skapar grottor. Tanken bör ha en relativt stark genomströmning.
Hanarna kan skiljas från honorna genom deras längre och bredare huvudprofil, samt de längre borst som de har bakom gällocket. Dessutom har könsmogna hanar fina odontoder på alla benplattor på kroppens bakre del.
Det finns flera populationer av Hemiancistrus sabaji som liknar varandra mycket, och det är osäkert om dessa representerar lokala varianter av arten, eller om de utgör flera distinkta arter.